Dana 30. januara 2025. godine, potpisan je sporazum o saradnji sa Evropskim univerzitetom u Bosni i Hercegovini, u gradu Brčko. Sporazum su potpisali prof. dr. Edmond Beqiri, prorektor za međunarodnu saradnju i unapređenje kvaliteta na Univerzitetu Haxhi Zeka, i prof. dr. Nedeljko Stanković, predsjednik Evropskog univerziteta u Brčkom.
Ovaj sporazum ima za cilj razmjenu profesora i studenata na svim nivoima studija između Evropskog univerziteta u Bosni i Hercegovini i Univerziteta Haxhi Zeka u Peći.
U okviru ove saradnje, strane će učestvovati i u različitim projektima finansiranim od strane Evropske unije, kao što su Erasmus+, Horizon i drugi programi razmjene i naučnog razvoja. Razmjena i saradnja će biti dugoročne, služeći kao inicijativa za izgradnju održivog partnerstva između dva univerziteta.
Također, ova saradnja će obuhvatiti različite naučne i profesionalne aktivnosti, organizaciju zajedničkih naučnih konferencija, kao i učešće u zajedničkim doktoratskim komisijama, mentorstvo doktoranata i druge akademske projekte.